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科研成果产业化基地
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国家人类基因组北方研究中心
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| 功能基因克隆、鉴定及重组蛋白表达技术平台 | |
| 细胞信号通路中药物基因靶标筛选的技术平台 | |
| 神经系统重要生理活性基因及其编码蛋白质的结构与功能研究平台 | |
生物信息学平台
生物信息学平台的任务是满足北方中心的生物信息学需求,并结合北方中心的其他平台,承担生物信息学相关课题和项目。生物信息学平台为北方中心圆满完成人类基因组部分测序、痢疾杆菌福氏2A(Shigella flexneri 2a strain 301,图1)全基因组测序、KV菌(Ketogulonicigenium vulgare)全基因组测序、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis ATCC 12228)基因组注释和红色毛癣菌(Trichophyton rubrum)EST测序等项目做出了重要贡献。
生物信息学平台目前包括测序与分析系统、基因表达谱数据系统和遗传数据系统。测序与分析系统包括如下主要步骤:测序前、测序、测序后组装前、组装、组装后预计算和注释(图2)。基因表达谱数据系统已建立了人胎肝、高血压、心肌肥厚、人胎脑等组织的基因表达数据库。遗传数据系统包括样本、家系、基因序列、表型等信息。
此外,我们也在构建和完善蛋白质组学系统、SNP分析系统。